1) esattamente di quale fusibile stiamo parlando? Se prendi il manuale d'uso dell'auto, cercando nella figura l'elenco dei fusibili e relé del cassetto portaoggetti quello che corrisponde al fusibile e al relé che hai sostituito, che numero e descrizione riporta il libretto? Perdona la domanda, ma non ho ben capito a quali ti riferisci (e, purtroppo, la disposizione e le funzioni di questi cambia spesso anche nello stesso modello di auto)
2) Quando salta il relé e/o il fusibile, smette di funzionare solo la pulsantiera del clima automatico? In questo caso, la ventola del clima sta ferma, o gira al massimo? C'è differenza se a saltare è il relé o il fusibile?
Io dubito che il relé sia la causa dei guasti, anche perché vorrebbe dire che i relé guasti siano 3 su 3: quello che c'era di fabbrica nell'auto, quello usato che hai comprato e quello non originale, un po' improbabile. Che il relé non originale si sia bruciato di fronte a un cortocircuito ci può stare, in teoria deve sempre saltare il fusibile, ma se il fusibile non era più quello originale di fabbrica e nemmeno il relé lo era, il forte picco di corrente potrebbe aver danneggiato i contatti interni del relé.
Se ora funziona, prova a usare tutte le funzioni del clima: cambiare i flussi, tempreatura in LO e poi in HI, attivare/disattivare il ricircolo, accendere e spegnere il clima, variare la velocità della ventola... se è un problema interno del sistema, dovrebbe essere più facile riprodurlo. Sicuro nel clima automatico non c'è una resistenza per regolare la velocità della ventola, perché viene controlato elettronicamente da una centralina che non fa uso di resistenze, ma usa un altro sistema puramente elettronico.